يعتبر المجلس عضوا في لجنتين داخل الانتوساي:

• لجنة بناء القدرات
• لجنة تبادل الخبرات

ويعتبر المجلس الأعلى للحسابات عضوا في العديد من مجموعات العمل بهذه المنظمة:

• مجموعة العمل المعنية بالرقابة البيئية (WGEA, Working Group on Environmental Auditing)، التي يعتبر المجلس عضوا في لجنة قيادتها، وعضوا في اللجنة التنفيذية لمشروع جهاز مسح المناخ الذي تشرف عليه مجموعة العمل المذكورة
• مجموعة العمل المعنية بمكافحة الفساد وغسل الأموال (WGFACML, Working Group on the Fight Against Corruption and Money Laundering)
• مجموعة العمل المعنية بأهداف التنمية المستدامة وبالمؤشرات الرئيسية للتنمية المستدامة (WGSDG, KSDI Working Group on SDGs and Key Sustainable Development Indicators).
• منتدى الأجهزة العليا للرقابة ذات الاختصاصات القضائية
• مجموعة عمل الانتوساي المعنية بالاستقرار المالي والاقتصادي (WGFES, Working Group on Financial and Economic Stability).
• مجموعة العمل المعنية بتقييم السياسات والبرامج العامة (WGEPPP, Working Group on Program and Public Policies Evaluation).

مبادرة تنمية الإنتوساي (IDI)

يساهم المجلس في برنامج شراكة دعم الأقران المعجل((PAP-APP، الذي تتولى تنسيقه مبادرة تنمية الانتوساي، وذلك عبر دعم المشاريع المتعلقة التالية:

• مشروع دعم قدرات محكمة الحسابات بجمهورية مدغشقر والذي يمتد بين الفترة 2020-2025
• مشروع دعم الأجهزة العليا للرقابة بغينيا والنيجر والتوغو لتنزيل المرحلة الثانية من برنامج دعم النظراء المعجل (PAP-APP